Composition du microbiote intestinal

Le tractus gastro-intestinal humain est colonisé sur toute sa longueur par des groupes complexes de micro-organismes. La composition exacte du microbiote intestinal varie d’une personne à l’autre, en fonction de l’endroit et de l’âge.

Dans le microbiote intestinal vivent aussi bien de bonnes bactéries que de mauvaises pour un total cent mille milliards de bactéries (1014)! C’est environ 10 fois plus que le nombre de cellules du corps. On estime que le tractus gastro-intestinal humain contient plus de 1.000 espèces différentes de bactéries [1,2,3,4].

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Certaines espèces sont présentes temporairement dans les intestins (espèces transitoires), alors que d’autres peuvent coloniser la paroi intestinale en permanence (espèces résidentes). La quantité de micro-organismes s’exprime en UFC/ml ou nombre d’unités formant colonie par millilitre.

Des études suggèrent différents types de microbiotes: les ‘entérotypes’, un peu comme les différents groupes sanguins [5,6] .

Bactéries pathogènes et protectrices (Kasper, 1998)

Une question d'équilibre?

Le microbiote est dit ‘équilibré’, lorsqu’il y a suffisamment de ‘bonnes bactéries’ dans l’intestin. Le microbiote de chaque individu étant unique, il est difficile de savoir ce qu’est un microbiote normal! En language scientifique, on parle d’eubiose [7].

Nous ne connaissons que 25 à 30% de la composition de la flore intestinale, c’est la pointe de l’iceberg [7]. Différentes études utilisant des analyses ADN sont en cours, afin d’en savoir plus sur la composition du microbiote.

 

Références

[1] Drasar, B.S. Hill, MJ. Human intestinal flora. Academic Press London, New York. 1974.

[2] Reid, G. Probiotics: guidelines science and human studies catch up with folklore, 2nd YLFA International Workshop, June 1st 2006, Vilnius, Lithuania. 

[3] Knösche, K. Identification DNA-microarray for the monitoring of intestinal bacteria during gastroenteritis. Fifth joint RRI-INRA Gastrointestinal Tract Microbiology Symposium, Gut Microbiology Research to improve health, immune respons and nutrition, 21 – 23 June 2006, Aberdeen, Scotland, UK. 

[4] Davies, J. In a Map for Human Life, Count the Microbes, Too. Science, March 2001: 2316.

[5] Arumugam, et al. Enterotypes of the human gut microbiome, Nature 2011, 473, 174-180.

[6] Yong, Gut microbial enterotypes become less clear-cut, Nature news, 2012.

[7] Doré, J. Metagenomics and Human Microbiomics Consortium, Inside the GI-tract. The light in the intestinal tract tunnel, ABS – VLAG Graduate School Course, 11 – 14 March 2009, Helsinki, Finland.